關渡宮正殿供奉天上聖母—媽祖。媽祖,姓林名默,祖籍福建莆田湄洲嶼,生於宋太祖建隆元年(960)3月23日,卒於雍熙4年(988),享年28歲。千年來人們對媽祖的稱呼,從通玄神女,而神姑、娘媽、媽祖婆,以至「天上聖母」,而官方封號則由夫人、妃、聖妃、天妃以至天后,給予最高的崇敬,至於臺灣民間社會的信眾,則恭敬而親切地暱稱為「媽祖婆」。千年來媽祖靈應的傳奇神蹟,經由民間社會的一再傳播,不僅成為沿海各地敬仰的全能神祇,更隨著漁夫、水手、海商及向海外的華人移民賈而傳遍海內外。
歷代以來朝廷對媽祖的誥封,從南宋高宗紹興26年(1156)郊典所賜封的「靈惠夫人」,到清朝咸豐七年(1857)為止,累積的封號共計有:「護國庇民、妙靈昭應、宏仁普濟、福佑群生、誠感咸孚、顯神贊順、垂慈篤祜、安瀾利運、澤覃海宇、恬波宣惠、導流衍慶、靖洋錫祉、恩周德溥、衛漕保泰、振武綏疆天后」等共六十二字,一般則簡稱為「天后」或「天上聖母」。
位於正殿中央的媽祖殿,是供奉主神媽祖的重要神龕,其內,尊像最大的媽祖像稱之為「鎮殿媽」,一般來說鎮殿媽是在廟裡的主龕中坐鎮,既不外出遶境、也不受理信眾的迎請。除此之外,關渡宮還供奉著許多媽祖的分身供像,其中開基建廟、最早供奉的媽祖像稱之為「大媽」,其後又會因於種種不同的因緣而增加媽祖的供像數量。因此媽祖的名號也隨之有所不同,例如按照數字排序命名的「二媽」、「三媽」一直到「廿六媽」;或是以正、副對應關係所稱的「副大媽」、「副二媽」和「副四媽」;另外則是為了彰顯媽祖的神威、慈悲、福慧、恩德與神力等,而直接冠上「慈安媽」、「慈濟媽」…等各種不同的封號。