位於媽祖殿的右次間是文昌帝君殿,與觀音佛祖殿的格局相似,面寬約9公尺、進深為11公尺左右,神龕前置有一張神桌和一張八仙桌,神桌上置有花瓶及供具,而八仙桌面則放有幾尊神像。神龕同樣以五邊形形式靠於後側牆面,上頭雕刻是以透雕和浮雕兩種技法呈現,並做有花籃和吊筒。至於文昌帝君神龕上方的匾額「孝友文章」,是為詮釋文昌帝君勸人誠實進取、行善積德、品學兼優和孝敬父母之初衷。